В геноме коронавируса нашли скрытый ген, ответственный за пандемию

Исследователи обнаружили новый «скрытый» ген SARS-CoV-2 — вируса, вызывающего COVID-19. Результаты исследования публикует журнал eLife.

Ученые предполагают, что именно обнаруженный ген — ORF3d —  причина уникальной биологии и пандемического потенциала SARS-CoV-2. В вирусе, который имеет всего около 15 генов, знание об этом и других перекрывающихся генах может существенно повлиять на борьбу с коронавирусом нового типа. 

Перерывающиеся гены, как понятно из их названия, перекрываются. Часть одного из них является одновременно и частью другого. Такие гены — редкое явление у клеточных форм жизни, но обычное для вирусов. Как полагают учёные, дело в том, что молекулы ДНК (или РНК) у вирусов очень короткие. Поэтому эволюция «нашла» способ использовать один и тот же участок молекулы сразу в нескольких генах.

Что касается размера генома, SARS-CoV-2 и его родственники — одни из самых длинных существующих РНК-вирусов.

Трудность в том, что обычные методы чтения генома не приспособлены для выявления перекрывающихся генов. Поэтому их иногда называют скрытыми генами.

«Перекрывающиеся гены отвечают за эволюцию коронавирусов для их эффективной репликации, подавления иммунитета хозяина или передачи инфекции, — объясняет ведущий автор нового исследования, Чейз Нельсон, научный сотрудник Академии Синика на Тайване. Иными словами, такой тип генов, как и обнаруженный ORF3d, вполне может отвечать за распространение вируса до масштабов пандемии.

ORF3d, новый перекрывающийся ген в SARS-CoV-2, присутствует в ранее обнаруженном коронавирусе панголинов. Кроме того, именно этот ген вызывает сильный ответ антител у пациентов с COVID-19.